RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 UBE2WQ96B02 151 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 XCL1P47992 114 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 NFE4Q86UQ8 179 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFA7O95182 113 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf85Q96MD7 179 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RS1O15537 224 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 HERVK_113P63121 156 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZSV7 163 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 CFAP161Q6P656 301 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM223A0PJW6 202 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01620Q4KN68 170 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 PRSS47A8MTI9 375 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-30P01768 117 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM89A2RUT3 159 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 CRLF1O75462 422 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 K7EQD1 137 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZSN1 163 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 MT-ATP8P03928 68 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 F5H768 121 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00315P59091 139 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 ODF3Q96PU9 254 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-33P01772 117 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 SCGB1A1P11684 91 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM86BQ8N661 226 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 SMR3AQ99954 134 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-211ENST00000503687 GYPEP15421 78 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF575Q86XF7 245 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIAP1O43715 76 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 PLA2G2AP14555 144 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 SS18Q15532 418 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 F8P00451 2351 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 UBE2D1P51668 147 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 Q9HAA7 133 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ATRQ13535 2644 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 DAD1P61803 113 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 MIAQ16674 131 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 DEFB135Q30KP9 77 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00694P0DN24 101 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF152Q8N8N0 203 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 C3orf56Q8N813 242 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 C16orf74Q96GX8 76 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 B5MCH6 92 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01006Q8NI28 216 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP5G1P05496 136 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 IFITM1P13164 125 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01546A6NGU7 62 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 CRYBA4P53673 196 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0B4J2C4 111 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 COX6A2Q02221 97 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.6 ms