RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 C11orf86A6NJI1 115 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0QY20 66 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSHBP01222 138 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRYGDP07320 174 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 HTN1P15515 57 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOC4P55056 127 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 RRN3P1Q2M238 152 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 AMTNQ6UX39 209 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 MDFICQ9P1T7 246 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 XCL2Q9UBD3 114 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 VWFP04275 2813 aa4.03□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 F8W1H4 67 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 G3V4G9 280 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 I3L3M4 83 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 INSP01308 110 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 NFE4Q86UQ8 179 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.02□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0J9YY99 117 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MTW9 85 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 EMP1P54849 157 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF415Q09FC8 603 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 COTL1Q14019 142 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF876PQ49A33 203 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTH2Q96A98 100 aa4.01□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MWV9 139 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 J3QQQ9 107 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 LEPROTO15243 131 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBMY1CP0DJD4 496 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2D1P51668 147 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 LYRM7Q5U5X0 104 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00467Q9BRT7 94 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANK2Q01484 3957 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM223A0PJW6 202 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 J3QR89 54 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0R2P5 195 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHODO00212 210 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 P0DMU3 169 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM231AP0DMU4 169 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM231CP0DMU5 169 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRYBA4P53673 196 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPXQ9BT56 116 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 VCX2Q9H322 139 aa3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0J9YXV3 536 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MZ25 164 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 H3BMG7 143 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSPAN13O95857 204 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV3-30P01768 117 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 WFDC2Q14508 124 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 C16orf74Q96GX8 76 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 AMELXQ99217 191 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRO0461Q9UI25 63 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.98□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM238C9JI98 176 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 RS1O15537 224 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOMO95445 188 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2D3P61077 147 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2D2P62837 147 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB135Q30KP9 77 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.97□□□□□ -1.77
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.97□□□□□ -1.77
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