RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 C5orf52A6NGY3 159 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 CIDEAO60543 219 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 ESDP10768 282 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 RHOHQ15669 191 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 Q8N8P6 123 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 C20orf78Q9BR46 151 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 ST20Q9HBF5 79 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00614P0C842 121 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 ESRGQ1W209 222 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 APLNQ9ULZ1 77 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 H3BNG1 76 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 RAB5BP61020 215 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 IGIPA6NJ69 53 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 H7C1H1 209 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 I3L3M4 83 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 PMCHP20382 165 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 BAGE3Q86Y29 109 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 Q8N976 141 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLL5B9A064 214 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R17O96001 155 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 FCER1GP30273 86 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 LAGE3Q14657 143 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 FA2HQ7L5A8 372 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 Q9H8V8 135 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 COTL1Q14019 142 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 TOMM6Q96B49 74 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 FABP4P15090 132 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 MPV17L2Q567V2 206 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 LELP1Q5T871 98 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZUT4 128 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 STPG4Q8N801 248 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC7Q8TAX7 377 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 HSBP1O75506 76 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 HBDP02042 147 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 C3orf79P0CE67 100 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 FGF6P10767 208 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 RBX1P62877 108 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 KIR2DL4Q99706 377 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM243Q9BU79 118 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A087WYN8 130 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 K7EMI3 77 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 CASC10Q5T4H9 136 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 BAALCQ8WXS3 180 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-212ENST00000491266 AMELXQ99217 191 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms