RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIDEA	O60543	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESD	P10768	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHOH	Q15669	191 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N8P6	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00614	P0C842	121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESRG	Q1W209	222 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BNG1	76 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB5B	P61020	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7C1H1	209 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266		I3L3M4	83 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMCH	P20382	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N976	141 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLL5	B9A064	214 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R17	O96001	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCER1G	P30273	86 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAGE3	Q14657	143 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q9H8V8	135 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	COTL1	Q14019	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	FABP4	P15090	132 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	LELP1	Q5T871	98 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZUT4	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	STPG4	Q8N801	248 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSBP1	O75506	76 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	HBD	P02042	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGF6	P10767	208 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBX1	P62877	108 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087WYN8	130 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7EMI3	77 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMELX	Q99217	191 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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