RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 SVBPQ8N300 66 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 NIT2Q9NQR4 276 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 SNAPINO95295 136 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 APOC3P02656 99 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 TRGC1P0CF51 173 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 AMTP48728 403 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 CFAP161Q6P656 301 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 HIGD1CA8MV81 97 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 CTRLP40313 264 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 RHEBQ15382 184 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 STPG4Q8N801 248 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 COTL1Q14019 142 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GUT8 65 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 NTF3P20783 257 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 RIGQ13278 110 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 TWIST1Q15672 202 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 CNFNQ9BYD5 112 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GW15 77 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 S100A8P05109 93 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 S100PP25815 95 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 IMMP2LQ96T52 175 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 A0A096LNI7 61 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 NUP35Q8NFH5 326 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0J9YXV3 536 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-8P60410 259 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 GATD1Q8NB37 220 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 BTF3L4Q96K17 158 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 LPAP08519 4548 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 FOXI1Q12951 378 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 HBBP68871 147 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 REG3GQ6UW15 175 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.47□□□□□ -0.57
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PTPRN-217ENST00000489650 CAMPP49913 170 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 COX19Q49B96 90 aa11.44□□□□□ -0.58
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PTPRN-217ENST00000489650 CCL25O15444 150 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 NCR2O95944 276 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 CARD19Q96LW7 228 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 H7C423 109 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 Q6ZRP5 223 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.41□□□□□ -0.58
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PTPRN-217ENST00000489650 GAS8-AS1O95177 125 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R17O96001 155 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 PMCHP20382 165 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 S100A1P23297 94 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 SMCO4Q9NRQ5 59 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GXF2 115 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 MRAP2Q96G30 205 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM101Q96IK0 257 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRN-217ENST00000489650 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.39□□□□□ -0.59
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PTPRN-217ENST00000489650 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
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PTPRN-217ENST00000489650 GAGE2BQ13066 116 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 AMN1Q8IY45 258 aa11.38□□□□□ -0.59
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PTPRN-217ENST00000489650 PPBPP02775 128 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 SS18Q15532 418 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PNN7 141 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 MT-ND6P03923 174 aa11.36□□□□□ -0.59
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PTPRN-217ENST00000489650 PTTG1IPP53801 180 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 TSHBP01222 138 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 ESDP10768 282 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.33□□□□□ -0.6
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