RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 AESQ08117 197 aa-1.25□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEDD8Q15843 81 aa-1.25□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-1.25□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf82Q8WW14 230 aa-1.25□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 DSCR8Q96T75 97 aa-1.25□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-1.25□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYH6P13533 1939 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 CBLN1P23435 193 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLRXP35754 106 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC122Q5T0U0 273 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 HACD4Q5VWC8 232 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF714Q96N38 554 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP1S3Q96PC3 154 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4C12Q96R67 309 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 ROCK1Q13464 1354 aa-1.26□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB108AA8MXU0 73 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BSH0 61 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R036 132 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNA7P01567 189 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNP1P09430 55 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARPP19P56211 112 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4B1Q8NGF8 309 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFT140Q96RY7 1462 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYH1P12882 1939 aa-1.27□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 F2Z2F3 143 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 RER1O15258 196 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BKO60814 126 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT-ND6P03923 174 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BJP06899 126 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHBP35232 272 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2D2P62837 147 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 EMX2Q04743 252 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB133Q30KQ1 61 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM97Q5BJF2 176 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM216BQ8N7L0 139 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 SELENOSQ9BQE4 189 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 C19orf12Q9NSK7 152 aa-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYH13Q9UKX3 1938 aa-1.28□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7EP13 123 aa-1.29□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01556Q5JQF7 62 aa-1.29□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 DMAC1Q96GE9 116 aa-1.29□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-1.29□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNFNQ9BYD5 112 aa-1.29□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-1.29□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 H0YGG7 62 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNPY4Q8N129 248 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENY2Q9NPA8 101 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 BIN3Q9NQY0 253 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAP12Q02952 1782 aa-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GW64 132 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R3E3 92 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXCL1P09341 107 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 PYYP10082 97 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYBAP13498 195 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 NFYBP25208 207 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM5Q71RC9 77 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q8IZM0 81 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC9CQ8N5M4 171 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 CARD19Q96LW7 228 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 SDF2Q99470 211 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABCC8Q09428 1581 aa-1.31□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7ERJ3 54 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPST1O60507 370 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRGC2P03986 189 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPRR1AP35321 89 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMBIM6P55061 237 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf140Q5VVS0 124 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 LYPD5Q6UWN5 251 aa-1.32□□□□□ -2.62
CACNA2D1-211ENST00000486539 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms