RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ACANP16112 2415 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 IGHG2P01859 326 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MIAQ16674 131 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MTORP42345 2549 aa11.93□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.93□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA4O00483 81 aa11.93□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 UQCRQO14949 82 aa11.93□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 U3KQE9 123 aa11.93□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 A6NDX4 124 aa11.92□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.92□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 J3KT08 172 aa11.92□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 Q9H8V8 135 aa11.92□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 B4DSR2 109 aa11.91□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NF1P21359 2839 aa11.91□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.91□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00643Q86TS7 51 aa11.91□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.91□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.91□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DNAL4O96015 105 aa11.9□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.9□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GX51 115 aa11.9□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 USMG5Q96IX5 58 aa11.89□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB136Q30KP8 78 aa11.89□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf47Q569G3 176 aa11.89□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.89□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 MED14OSP0DP75 135 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 Q9UF83 564 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TRACP01848 142 aa11.88□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.87□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.87□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 JMJD1CQ15652 2540 aa11.87□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.87□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 DSCR8Q96T75 97 aa11.87□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ACYP1P07311 99 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 LITAFQ99732 161 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 PEMTQ9UBM1 199 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TIRAPP58753 221 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-9P60411 292 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N2B8 174 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 CHD6Q8TD26 2715 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WVE0 104 aa11.85□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.85□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.85□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 SOCS3O14543 225 aa11.85□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 COX7CP15954 63 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-204ENST00000483092 COX7A2LO14548 114 aa11.83□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.83□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 RNF152Q8N8N0 203 aa11.83□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.83□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0J9YX75 114 aa11.82□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV1-40P01703 118 aa11.82□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.82□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXCQ9NY87 97 aa11.82□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KLLNB2CW77 178 aa11.81□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5G1P05496 136 aa11.81□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.81□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 IMUPQ9GZP8 106 aa11.81□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.81□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KLK9Q2XQG4 91 aa11.8□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.79□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ATOX1O00244 68 aa11.79□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 PSMB8P28062 276 aa11.79□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.79□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 DCANP1Q8TF63 244 aa11.79□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.78□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SLURP1P55000 103 aa11.78□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.78□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-53P01767 116 aa11.78□□□□□ -0.52
CCSAP-204ENST00000483092 H3BUA1 57 aa11.77□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CRPP02741 224 aa11.77□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.77□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ITPR3Q14573 2671 aa11.77□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 COX6A2Q02221 97 aa11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf85Q96MD7 179 aa11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SLPIP03973 132 aa11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00158P58513 81 aa11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.4 ms