RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1-203ENST00000481081 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
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CASQ1-203ENST00000481081 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.64□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 Q8N3U1 123 aa4.63□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 M0QY20 66 aa4.62□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 C3orf79P0CE67 100 aa4.62□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.61□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.61□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 A8MWV9 139 aa4.61□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 C20orf78Q9BR46 151 aa4.61□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 FCER1GP30273 86 aa4.6□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 ST20Q9HBF5 79 aa4.6□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R17O96001 155 aa4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.59□□□□□ -1.67
CASQ1-203ENST00000481081 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.59□□□□□ -1.67
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CASQ1-203ENST00000481081 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.57□□□□□ -1.68
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