RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.69□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.69□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.69□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC01546A6NGU7 62 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 I3L3M4 83 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SERF1AO75920 110 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUDT3O95989 172 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FCER1GP30273 86 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00310P59036 64 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FHL2Q14192 279 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LAGE3Q14657 143 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IQCJQ1A5X6 159 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTC32Q5I0X7 151 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.68□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAS8-AS1O95177 125 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AMTP48728 403 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CRYBA4P53673 196 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COTL1Q14019 142 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q6ZSN1 163 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LEPROTL1O95214 131 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HBDP02042 147 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AKR1D1P51857 326 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBE2D3P61077 147 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBE2D2P62837 147 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q9H8V8 135 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.66□□□□□ -1.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A096LPF7 62 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE12JA6NER3 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C16orf90A8MZG2 172 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H7C423 109 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBE2L6O14933 153 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATP5LO75964 103 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPSP0C0P6 89 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FABP4P15090 132 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PKIAP61925 76 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE1Q13065 139 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE4Q13068 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE5Q13069 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ESRGQ1W209 222 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOMM6Q96B49 74 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.65□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A0J9YY99 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRIAP1O43715 76 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUPR1O60356 82 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSHBP01222 138 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00694P0DN24 101 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q6ZN92 141 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERASQ7Z444 233 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q8N1X5 172 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM141Q96I45 108 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TIMM17AQ99595 171 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAT1Q14517 4588 aa3.64□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C20orf202A1L168 122 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 K7EP13 123 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TIRAPP58753 221 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PMCHL1Q16048 86 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM101Q96IK0 257 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.63□□□□□ -1.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM243Q9BU79 118 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms