RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 HBDP02042 147 aa-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 CRYBA4P53673 196 aa-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 SELENOSQ9BQE4 189 aa-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 RPRMQ9NS64 109 aa-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 MYH1P12882 1939 aa-2.47□□□□□ -2.8
SSB-208ENST00000468600 MAP3K1Q13233 1512 aa-2.47□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-2.47□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 CRYGSP22914 178 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 CDKN2CP42773 168 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 UBE2D1P51668 147 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 FDCSPQ8NFU4 85 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-2.48□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 PTPRMP28827 1452 aa-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 APOC3P02656 99 aa-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 BTG2P78543 158 aa-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 MED23Q9ULK4 1368 aa-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 H7BZZ5 65 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 CCL22O00626 93 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 IFNA17P01571 189 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 RGS21Q2M5E4 152 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 BAGE2Q86Y30 109 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 C10orf82Q8WW14 230 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 GINS3Q9BRX5 216 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 HIGD1BQ9P298 99 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 PATJQ8NI35 1801 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 ATMQ13315 3056 aa-2.5□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 ZNF236Q9UL36 1845 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 UQCR11O14957 56 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 B2MP61769 119 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 LELP1Q5T871 98 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 PPP1R14BQ96C90 147 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 SPRR4Q96PI1 79 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 V9GYH0 126 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 BCORQ6W2J9 1755 aa-2.51□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 DNAH5Q8TE73 4624 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 S100A11P31949 105 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 Q6AWC8 147 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-2.52□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 LRRC37A3O60309 1634 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 MGPP08493 103 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 TPPP2P59282 170 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 STX12Q86Y82 276 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 CBLN4Q9NTU7 201 aa-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
SSB-208ENST00000468600 J3QLW9 94 aa-2.54□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 NIPSNAP2O75323 286 aa-2.54□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 CTXN2P0C2S0 81 aa-2.54□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 HSD11B1P28845 292 aa-2.54□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-2.54□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 M0QZK8 103 aa-2.55□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 UQCRQO14949 82 aa-2.55□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 C10orf113Q5VZT2 155 aa-2.55□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 OR13C6PQ8NH95 151 aa-2.55□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-2.55□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 IFNA1P01562 189 aa-2.56□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 UBE2G1P62253 170 aa-2.56□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 Q6ZUT4 128 aa-2.56□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 MYH8P13535 1937 aa-2.56□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 MYH7P12883 1935 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 RBP4P02753 201 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 NEFHP12036 1026 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 LINC01600Q96MT4 127 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-2.58□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 FAM107AO95990 144 aa-2.58□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-2.58□□□□□ -2.82
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