RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM101Q96IK0 257 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 XCL1P47992 114 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 CAMPP49913 170 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 MRAP2Q96G30 205 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 F8W036 122 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 SMKR1H3BMG3 65 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 H7C423 109 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 RAB4AP20338 218 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 COX6A2Q02221 97 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 COMMD7Q86VX2 200 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 AMN1Q8IY45 258 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 A0A087WYN8 130 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM218A2RU14 115 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 PPP1R17O96001 155 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 TSHBP01222 138 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 HBBP68871 147 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 CCL25O15444 150 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 OXTP01178 125 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 RNF185Q96GF1 192 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 ESDP10768 282 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 FOXI1Q12951 378 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 MAJINQ3KP22 176 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 FCER1GP30273 86 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 CKS2P33552 79 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 SS18Q15532 418 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 SEC11CQ9BY50 192 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-212ENST00000468164 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00862A6NCI5 91 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GXF2 115 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 VCYO14598 125 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 PHOX2AO14813 284 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 C7orf33Q8WU49 177 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 ADCYAP1P18509 176 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 STPG4Q8N801 248 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 KIR2DL4Q99706 377 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 A0A096LNI7 61 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 PPBPP02775 128 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 NRACQ8N912 160 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 CARD19Q96LW7 228 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 IMMP2LQ96T52 175 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 D6R8Y8 96 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 MALP21145 153 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 S100PP25815 95 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 C20orf78Q9BR46 151 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 TNFRSF6BO95407 300 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 ORMDL3Q8N138 153 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 TCAPO15273 167 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 SYCNQ0VAF6 134 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFA5Q16718 116 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM18Q96B42 140 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 COX7A2LO14548 114 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 RHEBQ15382 184 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZRU5 148 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZUT4 128 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 PRELID3AQ96N28 172 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 NPYP01303 97 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms