RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466635.1

SYP-203, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-203ENST00000466635 ENHOQ6UWT2 76 aa9.03□□□□□ -0.96
SYP-203ENST00000466635 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.03□□□□□ -0.96
SYP-203ENST00000466635 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.03□□□□□ -0.96
SYP-203ENST00000466635 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.03□□□□□ -0.96
SYP-203ENST00000466635 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.02□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 LINC01549A6NIU2 74 aa9.02□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 RTL8CO15255 209 aa9.02□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.02□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.02□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.02□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.01□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 BAGE3Q86Y29 109 aa9.01□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.01□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 PRSS29PA6NIE9 313 aa9□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 TOMM6Q96B49 74 aa9□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 NPSP0C0P6 89 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 Q6ZN92 141 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 Q6ZUT4 128 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 DNAH2Q9P225 4427 aa8.98□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.97□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 EREGO14944 169 aa8.97□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 CCL25O15444 150 aa8.97□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 SS18Q15532 418 aa8.97□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 ERASQ7Z444 233 aa8.97□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 TMEM141Q96I45 108 aa8.97□□□□□ -0.97
SYP-203ENST00000466635 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 IGIPA6NJ69 53 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HBDP02042 147 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 TNP2Q05952 138 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 TIMM17AQ99595 171 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 VCX2Q9H322 139 aa8.96□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 IFITM10A6NMD0 228 aa8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HSBP1O75506 76 aa8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.95□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.94□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.94□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 PMCHL1Q16048 86 aa8.94□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.94□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 A0A087WTM6 91 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BKO60814 126 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 SERF1AO75920 110 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BJP06899 126 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BOP23527 126 aa8.93□□□□□ -0.98
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SYP-203ENST00000466635 XCL1P47992 114 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BDP58876 126 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BCP62807 126 aa8.93□□□□□ -0.98
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SYP-203ENST00000466635 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 BAALCQ8WXS3 180 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 FAM104AQ969W3 186 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.93□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 ATP5LO75964 103 aa8.92□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.92□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.92□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.92□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 AMELXQ99217 191 aa8.92□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 A0A096LNJ9 63 aa8.91□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.91□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.91□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.91□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 LECT2O14960 151 aa8.9□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 C14orf177Q52M58 125 aa8.9□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 CFAP161Q6P656 301 aa8.9□□□□□ -0.98
SYP-203ENST00000466635 UBE2D1P51668 147 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 SEC11AP67812 179 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 FOXI1Q12951 378 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 USP17L23D6RBM5 183 aa8.88□□□□□ -0.99
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SYP-203ENST00000466635 NDUFA6P56556 154 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 LINC00310P59036 64 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 PMVKQ15126 192 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 Q8N814 137 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 CST9LQ9H4G1 147 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 A0A1B0GVY2 172 aa8.87□□□□□ -0.99
SYP-203ENST00000466635 NUPR1O60356 82 aa8.87□□□□□ -0.99
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