RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442312.6

SH3BP2-203, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-203ENST00000442312 PRO0255Q9UI72 69 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 SPRY2O43597 315 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 E7EUB6 86 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 ACANP16112 2415 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP2-203ENST00000442312 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 INSL3P51460 131 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 M0QY20 66 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 CASC2Q6XLA1 102 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 MYCNOSP40205 109 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 A0A087WW49 117 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 SPRNQ5BIV9 151 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC140Q96MF4 163 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 M0QXV9 152 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 CCKP06307 115 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 NRACQ8N912 160 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 MTORP42345 2549 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 REG3AQ06141 175 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 RNF185Q96GF1 192 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 IGLV2-11P01706 119 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 KLK12Q9UKR0 248 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 ODF3BA8MYP8 253 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 LINC00694P0DN24 101 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 MIFP14174 115 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 PIP4P1Q86T03 277 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-203ENST00000442312 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 Q8N7P7 452 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 SNURFQ9Y675 71 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 SIRPDQ9H106 197 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 IGF1P05019 195 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 UBE2D3P61077 147 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 UBE2D2P62837 147 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 F8W735 103 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 DEFB135Q30KP9 77 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 Q6ZPA2 131 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 CRIP1P50238 77 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 PMAIP1Q13794 54 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 TSHBP01222 138 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 K7EQG2 157 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 Q8N9L7 120 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-203ENST00000442312 C6orf99Q4VX62 202 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 SLPIP03973 132 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 C3orf84H3BNL1 204 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 UBE2D1P51668 147 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 Q6ZTI0 123 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 KLLNB2CW77 178 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 A6NDX4 124 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 EBI3Q14213 229 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 SCXQ7RTU7 201 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 M0R378 163 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-203ENST00000442312 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms