RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 C16orf74Q96GX8 76 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-53P01767 116 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB37Q96AX2 223 aa4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 LEPROTO15243 131 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RS1O15537 224 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 AZU1P20160 251 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 FXYD2P54710 66 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZVH6 145 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF479Q96JC4 524 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE12BA1L429 117 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 J3QQQ9 107 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EQD1 137 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RRN3P1Q2M238 152 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 XCL2Q9UBD3 114 aa4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM223A0PJW6 202 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 J3QR89 54 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV1-51P01701 117 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 INSL3P51460 131 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL17DQ8TAD2 202 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 COPS9Q8WXC6 57 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 SORL1Q92673 2214 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GWB2 263 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2L6O14933 153 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 C12orf74Q32Q52 190 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMELXQ99217 191 aa4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0J9YY99 117 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLL5B9A064 214 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 F8W1H4 67 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 H7C423 109 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7ERJ3 54 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 P0DMU3 169 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM231AP0DMU4 169 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM231CP0DMU5 169 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMP1P54849 157 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERVK_113P63121 156 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM101Q96IK0 257 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2D1P51668 147 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SVIPQ8NHG7 77 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 VPS25Q9BRG1 176 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.51□□□□□ -1.69
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