RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR73Q6P4I2 378 aa8.32□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPPP3Q9BW30 176 aa8.32□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.32□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.31□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLC6P0CF74 106 aa8.31□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C15orf56Q8N910 161 aa8.31□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.31□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2L6O14933 153 aa8.3□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRGC2P03986 189 aa8.3□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASL11AQ6T310 242 aa8.3□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.3□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.3□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 V9GYV3 84 aa8.3□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNG7P62955 275 aa8.29□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX6A2Q02221 97 aa8.29□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMTP48728 403 aa8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP161Q6P656 301 aa8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01600Q96MT4 127 aa8.28□□□□□ -1.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRGC1P0CF51 173 aa8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COTL1Q14019 142 aa8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAJINQ3KP22 176 aa8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTSF1Q8WW33 167 aa8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIT2Q9NQR4 276 aa8.27□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKRY2A2RUG3 117 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf52A6NGY3 159 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BKO60814 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BJP06899 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BOP23527 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BBP33778 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BDP58876 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BCP62807 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ODF1Q14990 250 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT11Q96G61 164 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.26□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.25□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F2Z2F3 143 aa8.25□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA6P56556 154 aa8.25□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.25□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STPG4Q8N801 248 aa8.25□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.25□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0J9YXV3 536 aa8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKR1D1P51857 326 aa8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX19Q49B96 90 aa8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A096LNI7 61 aa8.23□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTF3P20783 257 aa8.23□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CT83Q5H943 113 aa8.23□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSKUQ8WUA8 353 aa8.23□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.23□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MWL6 223 aa8.22□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.22□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-ND6P03923 174 aa8.21□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTRLP40313 264 aa8.21□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REG3GQ6UW15 175 aa8.21□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.21□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.21□□□□□ -1.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.2□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP10-8P60410 259 aa8.2□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXI1Q12951 378 aa8.2□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATD1Q8NB37 220 aa8.2□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.2□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM231BA6NCW3 169 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C423 109 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCR2O95944 276 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APCSP02743 223 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TWIST1Q15672 202 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP35Q8NFH5 326 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNFNQ9BYD5 112 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIGD1CA8MV81 97 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100A8P05109 93 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF6P10767 208 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.18□□□□□ -1.1
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