RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 APOC4P55056 127 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CSTL1Q9H114 145 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PKD1P98161 4303 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-53P01767 116 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 HTN1P15515 57 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RRN3P1Q2M238 152 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SPATA45Q537H7 98 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TOMM6Q96B49 74 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TIMM17AQ99595 171 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 JPT2Q9H910 190 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 I3L3M4 83 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 AZU1P20160 251 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 C18orf15Q96N68 181 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 AGRNO00468 2067 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GUV1 79 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LINC00587B1AMM8 73 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 K7EQD1 137 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PLNP26678 52 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZN92 141 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ERASQ7Z444 233 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TMEM141Q96I45 108 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PRO1933Q9H354 126 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVY2 172 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 F8VRH5 84 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 H0Y8G0 127 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TSHBP01222 138 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGLC3P0DOY3 106 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP10-5P60370 271 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZTI0 123 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ATOH7Q8N100 152 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WX48 190 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 GAGE10A6NGK3 116 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LYRM9A8MSI8 78 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A8MZ25 164 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DPM2O94777 84 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGKCP01834 107 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PRSS1P07477 247 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MIFP14174 115 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CRYBA4P53673 196 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 BAALCQ8WXS3 180 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RNF183Q96D59 192 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MYCBP2O75592 4640 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 hDV102S1A0JD36 115 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 IGIPA6NJ69 53 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 PRM2P04554 102 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 COTL1Q14019 142 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 RETNQ9HD89 108 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms