RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 M0R2N4 97 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HSBP1O75506 76 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 REG3AQ06141 175 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 C6orf223Q8N319 242 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q8N976 141 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 TOMM6Q96B49 74 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM141Q96I45 108 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.55□□□□□ -1.36
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TRBV20-1-201ENST00000390394 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 ERASQ7Z444 233 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBE2WQ96B02 151 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 TIMM17AQ99595 171 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRR34Q9NV39 138 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.53□□□□□ -1.36
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TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BKO60814 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BJP06899 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BOP23527 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BBP33778 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BDP58876 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BCP62807 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 SS18Q15532 418 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.52□□□□□ -1.36
TRBV20-1-201ENST00000390394 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 ATP5LO75964 103 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 VCX2Q9H322 139 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q9HAA7 133 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 SERF1AO75920 110 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 SEC11AP67812 179 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 ENHOQ6UWT2 76 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGIPA6NJ69 53 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 EREGO14944 169 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 S100A6P06703 90 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q8N3U1 123 aa6.5□□□□□ -1.37
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TRBV20-1-201ENST00000390394 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.49□□□□□ -1.37
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TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZUT4 128 aa6.49□□□□□ -1.37
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TRBV20-1-201ENST00000390394 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.48□□□□□ -1.37
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TRBV20-1-201ENST00000390394 NDUFA6P56556 154 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 C14orf177Q52M58 125 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 CFAP161Q6P656 301 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 AMELXQ99217 191 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.47□□□□□ -1.37
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TRBV20-1-201ENST00000390394 PMCHL1Q16048 86 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV20-1-201ENST00000390394 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.47□□□□□ -1.37
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TRBV20-1-201ENST00000390394 PRSS1P07477 247 aa6.46□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 HERVK_113P63121 156 aa6.46□□□□□ -1.38
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TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.46□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 BAALCQ8WXS3 180 aa6.46□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.46□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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TRBV20-1-201ENST00000390394 APOMO95445 188 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 MALP21145 153 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 S100A2P29034 98 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 XCL1P47992 114 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 COX7A2LO14548 114 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 RTL8CO15255 209 aa6.44□□□□□ -1.38
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBE2D1P51668 147 aa6.44□□□□□ -1.38
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