RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 G0S2P27469 103 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCL8P80075 99 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 AQP10Q96PS8 301 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFSF15O95150 251 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPTSSAQ969W0 71 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPEF2Q9C093 1822 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 HMGXB3Q12766 1538 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCTP09683 121 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 C10orf128Q5T292 105 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCIMPQ6UWF3 145 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIGD1AQ9Y241 93 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1B0GX51 115 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 UQCR11O14957 56 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPPP2P59282 170 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q6AWC8 147 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 MMGT1Q8N4V1 131 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 USMG5Q96IX5 58 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMELXQ99217 191 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 PBRM1Q86U86 1689 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADGRB1O14514 1584 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIX6O95475 246 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q6ZUT4 128 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAC4Q86UU9 113 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 ARPC5O15511 151 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFB6O95139 128 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 PATJQ8NI35 1801 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFT140Q96RY7 1462 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKAP9Q99996 3911 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 BTAF1O14981 1849 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-1.51□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 E2F6O75461 281 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNG10P50151 68 aa-1.51□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC9CQ8N5M4 171 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAMA1P25391 3075 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-1.52□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SLIT1O75093 1534 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-1.53□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-1.53□□□□□ -2.65
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RNU6-601P-201ENST00000384540 COL4A6Q14031 1691 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 OVOS2Q6IE36 1432 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 FDCSPQ8NFU4 85 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPANXCQ9NY87 97 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSPB11Q9Y547 144 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q8N8P6 123 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 V9GYQ6 96 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALX1Q15699 326 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDC26Q8NHZ8 85 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPHQ9H3R5 247 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMPXQ9UHP9 88 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 MT1AP04731 61 aa-1.56□□□□□ -2.66
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