RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.35□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.35□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 MP68P56378 58 aa10.35□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 CXCL6P80162 114 aa10.34□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.34□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZS46 218 aa10.34□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa10.34□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 IGHV4-59P01825 116 aa10.34□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.34□□□□□ -0.75
CTIF-202ENST00000382998 A0A0J9YXV3 536 aa10.33□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.33□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.33□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 MSMPQ1L6U9 139 aa10.33□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 HTN3P15516 51 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 PVRIGQ6DKI7 326 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 TOMM6Q96B49 74 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 SZT2Q5T011 3432 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 NCR3O14931 201 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 IGF1P05019 195 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 A0A0J9YXY3 114 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 IGLV2-14P01704 120 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 HILS1P60008 231 aa10.32□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 G3V318 75 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 DCANP1Q8TF63 244 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 F8P00451 2351 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 MIAQ16674 131 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 LCA10Q71F78 164 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 Q9H8V8 135 aa10.31□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 PRYO14603 147 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 CASC2Q6XLA1 102 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 SCXQ7RTU7 201 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 PRR15Q8IV56 129 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 NREPQ16612 68 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 ATP6V0E1O15342 81 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WWL8 130 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 PDE6HQ13956 83 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 RNF5Q99942 180 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTIF-202ENST00000382998 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZVQ6 151 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 A0A096LNJ9 63 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 OVOL3O00110 214 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 CENPEQ02224 2701 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 INAFM1C9JVW0 142 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 WT1-ASQ06250 92 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 LINC00846Q9NV44 126 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-9P60411 292 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 INSP01308 110 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 HCG22E2RYF7 251 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 LHBP01229 141 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 CELA1Q9UNI1 258 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 U3KQK5 164 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 KMT2EQ8IZD2 1858 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 USMG5Q96IX5 58 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 DNAH14Q0VDD8 3507 aa10.21□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 COX7B2Q8TF08 81 aa10.21□□□□□ -0.77
CTIF-202ENST00000382998 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.21□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 SLPIP03973 132 aa10.2□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 PATE2Q6UY27 113 aa10.2□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.2□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10.19□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 LMO4P61968 165 aa10.19□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 BPY2O14599 106 aa10.19□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 Q8N3U1 123 aa10.19□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 TRGV2A0A075B6R0 118 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 PDE6GP18545 87 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 DEFB136Q30KP8 78 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 VCANP13611 3396 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 NDUFB1O75438 58 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 LIMD2Q9BT23 127 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-202ENST00000382998 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.3 ms