RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 UBE2L6O14933 153 aa12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 PKIAP61925 76 aa12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 GAGE6Q13070 117 aa12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.37□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 C5orf52A6NGY3 159 aa12.36□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 FGF6P10767 208 aa12.36□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.36□□□□□ -0.43
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PTX4-201ENST00000293922 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.36□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.35□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 HIST3H2BBQ8N257 126 aa12.35□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.35□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GUV1 79 aa12.34□□□□□ -0.43
PTX4-201ENST00000293922 IGIPA6NJ69 53 aa12.34□□□□□ -0.43
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PTX4-201ENST00000293922 TMEM262E9PQX1 116 aa12.33□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 RBX1P62877 108 aa12.33□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 MPV17L2Q567V2 206 aa12.33□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa12.33□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 ERASQ7Z444 233 aa12.33□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 TIMM17AQ99595 171 aa12.33□□□□□ -0.44
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PTX4-201ENST00000293922 NPSP0C0P6 89 aa12.32□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.32□□□□□ -0.44
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PTX4-201ENST00000293922 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.32□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 HSPG2P98160 4391 aa12.32□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 LEPROTL1O95214 131 aa12.31□□□□□ -0.44
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PTX4-201ENST00000293922 TMEM141Q96I45 108 aa12.31□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 APOBP04114 4563 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 ATP5LO75964 103 aa12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 Q8N3U1 123 aa12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 FAM104AQ969W3 186 aa12.3□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 TMEM101Q96IK0 257 aa12.3□□□□□ -0.44
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PTX4-201ENST00000293922 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.29□□□□□ -0.44
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PTX4-201ENST00000293922 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.29□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 FABP4P15090 132 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 S100A2P29034 98 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZUT4 128 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 HIST1H2BLQ99880 126 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 IFITM10A6NMD0 228 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.28□□□□□ -0.44
PTX4-201ENST00000293922 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
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PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-33P01772 117 aa12.27□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.27□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.27□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.27□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 C16orf90A8MZG2 172 aa12.26□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 K7EP13 123 aa12.26□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZN92 141 aa12.25□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 BAALCQ8WXS3 180 aa12.25□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 AMELXQ99217 191 aa12.25□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.24□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 PRR34Q9NV39 138 aa12.24□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 KLK12Q9UKR0 248 aa12.24□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 ABCA13Q86UQ4 5058 aa12.24□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.23□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.23□□□□□ -0.45
PTX4-201ENST00000293922 VCX2Q9H322 139 aa12.23□□□□□ -0.45
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PTX4-201ENST00000293922 TEX43Q6ZNM6 134 aa12.22□□□□□ -0.45
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PTX4-201ENST00000293922 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.2□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.2□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 ENHOQ6UWT2 76 aa12.2□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 NFE4Q86UQ8 179 aa12.2□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa12.19□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 C3orf79P0CE67 100 aa12.19□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.19□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 CRPP02741 224 aa12.18□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 UBE2D1P51668 147 aa12.18□□□□□ -0.46
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