RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 UBE2WQ96B02 151 aa7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 J3QLI3 93 aa7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 SNCGO76070 127 aa7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.2□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 B5MCH6 92 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 COX6A2Q02221 97 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 M0QXV9 152 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE2BQ13066 116 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE2EQ4V326 116 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 Q96MF0 132 aa7.19□□□□□ -1.26
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CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.19□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.18□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 CCDC179H3BU77 68 aa7.18□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.18□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.18□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF843Q8N446 348 aa7.18□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM89A2RUT3 159 aa7.17□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 FSHBP01225 129 aa7.17□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.17□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM101Q96IK0 257 aa7.17□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 ACANP16112 2415 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 LINC00694P0DN24 101 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 LINC01587Q99440 93 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 MTORP42345 2549 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 JMJD1CQ15652 2540 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 TENM4Q6N022 2769 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 LST1O00453 97 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 Q8N2B8 174 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.16□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 A0A1W2PRX2 142 aa7.15□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 IGHV3-53P01767 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF415Q09FC8 603 aa7.15□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.15□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.15□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 Q9H8V8 135 aa7.15□□□□□ -1.26
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE5Q13069 117 aa7.15□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE6Q13070 117 aa7.15□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 IFITM1P13164 125 aa7.14□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 RNF152Q8N8N0 203 aa7.14□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.14□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.14□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 XCL2Q9UBD3 114 aa7.14□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.13□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 COX6CP09669 75 aa7.13□□□□□ -1.27
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CHRNA6-201ENST00000276410 H3BT86 120 aa7.13□□□□□ -1.27
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CHRNA6-201ENST00000276410 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.13□□□□□ -1.27
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CHRNA6-201ENST00000276410 C3orf56Q8N813 242 aa7.13□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.12□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 A8MTW9 85 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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CHRNA6-201ENST00000276410 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 PEMTQ9UBM1 199 aa7.11□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE12JA6NER3 117 aa7.1□□□□□ -1.27
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CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE7O76087 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE12FP0CL80 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE12GP0CL81 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE12IP0CL82 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 GAGE4Q13068 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 RS1O15537 224 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 TIRAPP58753 221 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.1□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 INSP01308 110 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZTI0 123 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 ITPR2Q14571 2701 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6Q795 121 aa7.09□□□□□ -1.27
CHRNA6-201ENST00000276410 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.09□□□□□ -1.27
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