RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM141Q96I45 108 aa13.3□□□□□ -0.28
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HOXD11-201ENST00000249504 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXD11-201ENST00000249504 M0R2N4 97 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXD11-201ENST00000249504 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
HOXD11-201ENST00000249504 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXD11-201ENST00000249504 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.29□□□□□ -0.28
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HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
HOXD11-201ENST00000249504 H7C423 109 aa13.26□□□□□ -0.29
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HOXD11-201ENST00000249504 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXD11-201ENST00000249504 ATOH7Q8N100 152 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXD11-201ENST00000249504 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.21□□□□□ -0.29
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HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZR54 194 aa13.21□□□□□ -0.29
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HOXD11-201ENST00000249504 Q8N3U1 123 aa13.21□□□□□ -0.29
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HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.18□□□□□ -0.3
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HOXD11-201ENST00000249504 VCX2Q9H322 139 aa13.18□□□□□ -0.3
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HOXD11-201ENST00000249504 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.18□□□□□ -0.3
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HOXD11-201ENST00000249504 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXD11-201ENST00000249504 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.17□□□□□ -0.3
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HOXD11-201ENST00000249504 SPATA45Q537H7 98 aa13.17□□□□□ -0.3
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HOXD11-201ENST00000249504 FAM104AQ969W3 186 aa13.14□□□□□ -0.31
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HOXD11-201ENST00000249504 hDV102S1A0JD36 115 aa13.13□□□□□ -0.31
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HOXD11-201ENST00000249504 KLK12Q9UKR0 248 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZUT4 128 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 PRO1933Q9H354 126 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 PRR34Q9NV39 138 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 REG3AQ06141 175 aa13.08□□□□□ -0.31
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