RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.91□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 M0R2P5 195 aa7.91□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 F8WDY8 70 aa7.9□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 H3BMM0 161 aa7.9□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 TEN1Q86WV5 123 aa7.9□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.9□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.9□□□□□ -1.14
PRRX1-201ENST00000239461 C2orf82Q6UX34 121 aa7.9□□□□□ -1.15
PRRX1-201ENST00000239461 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 FAM236CP0DP71 79 aa7.89□□□□□ -1.15
PRRX1-201ENST00000239461 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.89□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 I3L3M4 83 aa7.88□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 SLC25A20O43772 301 aa7.87□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PRRX1-201ENST00000239461 C12orf74Q32Q52 190 aa7.87□□□□□ -1.15
PRRX1-201ENST00000239461 BAALCQ8WXS3 180 aa7.87□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 C16orf95Q9H693 158 aa7.86□□□□□ -1.15
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PRRX1-201ENST00000239461 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.83□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.83□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 GAS8-AS1O95177 125 aa7.83□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.83□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 PRO0628Q9UI54 55 aa7.83□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 hADV29S1A0JD25 119 aa7.82□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF815PA8K554 130 aa7.82□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.82□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.82□□□□□ -1.16
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PRRX1-201ENST00000239461 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.8□□□□□ -1.16
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PRRX1-201ENST00000239461 TIMM17AQ99595 171 aa7.8□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1B0GX51 115 aa7.8□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.79□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.79□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PRRX1-201ENST00000239461 A0A096LNJ9 63 aa7.79□□□□□ -1.16
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