RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM104AQ969W3 186 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 VCX2Q9H322 139 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 H7C423 109 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB130BP0DP73 79 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB130AP0DP74 79 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 C11orf86A6NJI1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 E9PLD3 99 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 PRO0255Q9UI72 69 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 NACAE9PAV3 2078 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 NMUP48645 174 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 STAB1Q9NY15 2570 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 G3V4G9 280 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 HERVK_113P61574 105 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 PCP2Q8IVA1 136 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM243Q9BU79 118 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 HIGD1BQ9P298 99 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 COL6A5A8TX70 2615 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5G1P05496 136 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 DAD1P61803 113 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 FBN3Q75N90 2809 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 ANK2Q01484 3957 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM223A0PJW6 202 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 GYPEP15421 78 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TIRAPP58753 221 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZUT4 128 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 CELA1Q9UNI1 258 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0J9YXV3 536 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB4AO15263 64 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2D1P51668 147 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 HSD52Q0P140 79 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2L6O14933 153 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 LEPROTO15243 131 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TCTAP57738 103 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC11AP67812 179 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM101Q96IK0 257 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC1-201ENST00000229304 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 TAL2Q16559 108 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 C12orf74Q32Q52 190 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 MPV17L2Q567V2 206 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GUV1 79 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BNG1 76 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 HERVK_113P63121 156 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 BATFQ16520 125 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 F5H768 121 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BRM9 83 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 J3QQQ9 107 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 GAGE6Q13070 117 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.62□□□□□ -1.35
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