RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r78K7N608 313 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BokO35425 213 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mamld1P0C6A2 803 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TgfaP48030 159 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Oosp2Q4FZG8 168 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmub1Q9JMG3 245 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Timm23Q9WTQ8 209 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ascl2O35885 263 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1537P34983 314 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rph3alQ768S4 302 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ncoa6Q9JL19 2067 aa11.88□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ros1Q78DX7 2340 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hist1h2bfP10853 126 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf575Q3TXZ1 239 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Repin1Q5U4E2 545 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hist1h2bbQ64475 126 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccsmst1Q6RUT7 136 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hist1h2bkQ8CGP1 126 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp708F8VPP0 541 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CntfrO88507 372 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BsgP18572 389 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SrstQ06666 185 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam173aQ501J2 229 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zc2hc1aQ8BJH1 324 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aqp6Q8C4A0 293 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10309Q8C648 119 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr346Q8VGJ7 309 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gatad1Q920S3 266 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ctnnbip1Q9JJN6 81 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cst10Q9JM84 148 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pard6aQ9Z101 346 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 F5O88783 2183 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Csmd2V9GX34 3611 aa11.87□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SlpiP97430 131 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OstcQ78XF5 149 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8CF25 301 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NbeaQ9EPN1 2936 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrebbpP45481 2441 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smim7Q5RKS2 75 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10334Q792Y8 246 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mixl1Q9WUI0 231 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5741B2RVA4 72 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adcyap1O70176 175 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LtaP09225 202 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sumo1P63166 101 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd200r3Q5UKY4 296 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr263Q7TQT8 317 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nit1Q8VDK1 323 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa11.86□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AU041133A0A0J9YVH3 498 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fgfbp1O70514 251 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arf6P62331 175 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr509Q8VF20 321 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cldn16Q925N4 235 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab9aQ9R0M6 201 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cmya5Q70KF4 3739 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P0C1Z5 52 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PpoxP51175 477 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem256Q5F285 113 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcf15Q60756 195 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr148Q60887 310 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slamf7Q8BHK6 333 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Saxo2Q8BQB6 394 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf182Q8C432 247 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rhbdd2Q8VEK2 361 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1242Q8VGM6 306 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1272Q8VGN8 308 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Urm1Q9D2P4 101 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TfpiO54819 306 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gcm1P70348 436 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf474Q6V5K9 347 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr984Q8VFN1 314 aa11.85□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 eef1akmt3D3YWP0 232 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21900J3QP38 180 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Timp3P39876 211 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OpalinQ7M750 143 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1434Q7TQR9 312 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rhbdd1Q8BHC7 315 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9945Q8BNZ3 91 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr959Q9EQ86 311 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tln2Q71LX4 2375 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01792 123 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnase9P60154 184 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r195Q5SVD6 316 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trp53rkaQ5U452 244 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tp53rkQ99PW4 244 aa11.84□□□□□ -0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv5-8A0A075B676 92 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Higd1cQ76I25 96 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr963Q7TRA9 311 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr127Q8VF25 323 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mpv17lQ99MS3 194 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stpg1Q9D2F5 341 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Khdc1bP0C7A0 126 aa11.83□□□□□ -0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 74.4 ms