RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598895.5

ZNF548-209, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ZNF548, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-209ENST00000598895 MAP3K12Q12852 859 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-209ENST00000598895 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 ENTPD3O75355 529 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 BAG3O95817 575 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 WRNIP1Q96S55 665 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 CSRNP1Q96S65 589 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 IGHDP01880 384 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MAP3K9P80192 1104 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 VGLL4Q14135 290 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SPRYD7Q5W111 196 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 DCAF15Q66K64 600 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 HOOK2Q96ED9 719 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 GPATCH3Q96I76 525 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 WNK4Q96J92 1243 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 HAUS7Q99871 368 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 FOCADQ5VW36 1801 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 FAM196BA6NMK8 535 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 CHGBP05060 677 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 PDE6AP16499 860 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 INPP5BP32019 993 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 LBX1P52954 281 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 GCC1Q96CN9 775 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 OPTNQ96CV9 577 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 CSADQ9Y600 493 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MYH7P12883 1935 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 PDE4AP27815 886 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 GJA5P36382 358 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 PPP4CP60510 307 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 AAMPQ13685 434 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 OTUD5Q96G74 571 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 TRPA1O75762 1119 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 PLCG2P16885 1265 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 USP5P45974 858 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 BACH2Q9BYV9 841 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 FLT1P17948 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 SIPA1L1O43166 1804 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MYH1P12882 1939 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 MX1P20591 662 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 LNPKQ9C0E8 428 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 RNF186Q9NXI6 227 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 PALD1Q9ULE6 856 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-209ENST00000598895 UNCXA6NJT0 531 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 IGSF3O75054 1194 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 ADD2P35612 726 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 SREBF2Q12772 1141 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 LCORLQ8N3X6 602 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 ARMT1Q9H993 441 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 LAMB1P07942 1786 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 DOCK1Q14185 1865 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 SMC5Q8IY18 1101 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-209ENST00000598895 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms