RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 DLGAP5Q15398 846 aa9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.67□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf42Q9H799 3197 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 TRIOO75962 3097 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 HMMRO75330 724 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 KLRK1P26718 216 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 IRF5Q13568 498 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 PANK1Q8TE04 598 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF3Q9H094 633 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 USP44Q9H0E7 712 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.66□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 RLFQ13129 1914 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 PLIN1O60240 522 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 COL6A1P12109 1028 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 FLT3LGP49771 235 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 FCGRTP55899 365 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 SNAPC2Q13487 334 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP100Q494V2 611 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 FBXW7Q969H0 707 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 COG6Q9Y2V7 657 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 FOSL2P15408 326 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CASP7P55210 303 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 GTF2IP78347 998 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 PPIL2Q13356 520 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ERO1BQ86YB8 467 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 MEIS3Q99687 375 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 VEZTQ9HBM0 779 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 PDHXO00330 501 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CSF1RP07333 972 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 RLBP1P12271 317 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ITGA6P23229 1130 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 SUCLG2Q96I99 432 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO3Q9UK99 471 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CSADQ9Y600 493 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 MYO1BO43795 1136 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 SRGAP3O43295 1099 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 FOXO4P98177 505 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 MTX1Q13505 466 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 TNFAIP1Q13829 316 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ASB2Q96Q27 587 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 GREM2Q9H772 168 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CYP2C8P10632 490 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 PPATQ06203 517 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CD209Q9NNX6 404 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 TNNQ9UQP3 1299 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms