RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ASIC4	Q96FT7	647 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	LEFTY1	O75610	366 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	NME2	P22392	152 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	MAPK1	P28482	360 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	BNIP3	Q12983	259 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	NETO1	Q8TDF5	533 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	MISP3	Q96FF7	219 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652		U3KQE9	123 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ERVK-24	P63145	666 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	PLCL1	Q15111	1095 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ISL2	Q96A47	359 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	OGFOD2	Q6N063	350 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF559-209	ENST00000591652	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.14	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CBX8	Q9HC52	389 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ENC1	O14682	589 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PAPLN	O95428	1278 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CD8B	P10966	210 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	BMP6	P22004	513 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	GSTT1	P30711	240 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	OXCT1	P55809	520 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PRKCQ	Q04759	706 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	FUT4	P22083	530 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	MAPK8	P45983	427 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PAGE1	O75459	146 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CEACAM5	P06731	702 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	NTF4	P34130	210 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CD96	P40200	585 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	FBXO24	O75426	580 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	TRIM37	O94972	964 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	RING1	Q06587	406 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	AOC3	Q16853	763 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	BIN1	O00499	593 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	GIPC1	O14908	333 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ZNF559-209	ENST00000591652	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	FANCG	O15287	622 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ITIH2	P19823	946 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	FZD5	Q13467	585 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.08	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms