RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.26■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.26■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 SREBF2Q12772 1141 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 PICALMQ13492 652 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 OPTNQ96CV9 577 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 CSADQ9Y600 493 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 FOCADQ5VW36 1801 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K10Q02779 954 aa24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 BCL11AQ9H165 835 aa24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 BAG3O95817 575 aa24.23■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP5JP18859 108 aa24.23■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 TEX11Q8IYF3 940 aa24.23■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 PLCG2P16885 1265 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP7A1P22680 504 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 INPP5BP32019 993 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 INHBEP58166 350 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K12Q12852 859 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.21■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 ERO1BQ86YB8 467 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 IFNL1Q8IU54 200 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 TNS4Q8IZW8 715 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 HAUS7Q99871 368 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 GOLIM4O00461 696 aa24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 OTUD5Q96G74 571 aa24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 SLURP2P0DP57 97 aa24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 AAMPQ13685 434 aa24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 SIPA1L1O43166 1804 aa24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 TBC1D12O60347 775 aa24.17■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.17■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.17■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PTPN18Q99952 460 aa24.17■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 FLT1P17948 1338 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 TBC1D8O95759 1140 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 ALDH1A1P00352 501 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PDE6AP16499 860 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PPATQ06203 517 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIL2Q13356 520 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 CERS3Q8IU89 383 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.16■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 GTF2A2P52657 109 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 IFFO2Q5TF58 517 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 DOCK1Q14185 1865 aa24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 IRF6O14896 467 aa24.14■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.14■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.13■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 MYH7P12883 1935 aa24.13■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM196BA6NMK8 535 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 CCL15Q16663 113 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 MYH1P12882 1939 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 ADD2P35612 726 aa24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 SNAPC2Q13487 334 aa24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms