RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SALL1Q9NSC2 1324 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP3K11Q16584 847 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 TNNI3KQ59H18 835 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ERICH6Q7L0X2 663 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SSH3Q8TE77 659 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 OPTNQ96CV9 577 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 TEPSINQ96N21 525 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 WRNIP1Q96S55 665 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 USP40Q9NVE5 1235 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 APBB1O00213 710 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 VGLL4Q14135 290 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP85Q6P2H3 762 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SLF2Q8IX21 1173 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA5Q8NB90 893 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ABHD8Q96I13 439 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 DBNDD2Q9BQY9 259 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SNRKQ9NRH2 765 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 RAI14Q9P0K7 980 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 HMG20BQ9P0W2 317 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 GJA5P36382 358 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MCAMP43121 646 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 BTDP43251 543 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MECOMQ03112 1051 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 NFIAQ12857 509 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 PICALMQ13492 652 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC158Q5M9N0 1113 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 DCAF15Q66K64 600 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM83AQ86UY5 434 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 HOOK2Q96ED9 719 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MRIQ9BWK5 157 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 LRP2BPQ9P2M1 347 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 DOCK2Q92608 1830 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 RGS3P49796 1198 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP3K9P80192 1104 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MAST2Q6P0Q8 1798 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 TM4SF4P48230 202 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 FKBP1CQ5VVH2 108 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM151AQ8WW52 585 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF341Q9BYN7 854 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 GAKO14976 1311 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 GSTO1P78417 241 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 AACSQ86V21 672 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR108Q9NPR9 543 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM198AQ9UFP1 575 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 UNCXA6NJT0 531 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR25O00155 361 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 HMMRO75330 724 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ALDH1A1P00352 501 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 INPP5BP32019 993 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 CCL15Q16663 113 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 LDHCP07864 332 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZAP70P43403 619 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 INHBEP58166 350 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms