RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580022.5

TSPOAP1-AS1-205, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,337 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.15■■■□□ 2.1
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SEMA3EO15041 775 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ADRA2BP18089 450 aa28.12■■■□□ 2.09
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.11■■■□□ 2.09
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.04■■■□□ 2.08
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CTR9Q6PD62 1173 aa28.03■■■□□ 2.08
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PRDM1O75626 825 aa28.02■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ST5P78524 1137 aa28.02■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.02■■■□□ 2.08
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 USP17L21D6R901 530 aa28.02■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.02■■■□□ 2.08
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