RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	ALG2	Q9H553	416 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	LAMB1	P07942	1786 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GUL6	1792 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	RTL9	Q8NET4	1388 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	WNT7A	O00755	349 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	HUNK	P57058	714 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF20	Q5VTR2	975 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	USP48	Q86UV5	1035 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP53	Q96M91	514 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	SZT2	Q5T011	3432 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH3	P11055	1940 aa		5.21	□□□□□ -1.57
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMD14	O00487	310 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	CA12	O43570	354 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXC1	Q12948	553 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	NOG	Q13253	232 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT24	Q2M2I5	525 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	PARP10	Q53GL7	1025 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	NLRP10	Q86W26	655 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	MPND	Q8N594	471 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	NLRP3	Q96P20	1036 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	NUDC	Q9Y266	331 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ERBB4	Q15303	1308 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	OTOF	Q9HC10	1997 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	GRAP	Q13588	217 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	NFE2L2	Q16236	605 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	RGMB	Q6NW40	437 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF186	Q9NXI6	227 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	GGA3	Q9NZ52	723 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ECE2	O60344	883 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPA1	O75762	1119 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	GPSM2	P81274	684 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	MOB2	Q70IA6	237 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	COPS6	Q7L5N1	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	CDCA5	Q96FF9	252 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	VPS33B	Q9H267	617 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	POLL	Q9UGP5	575 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF609	O15014	1411 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093		H7C1D1	291 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-206	ENST00000578093	SIAH2	O43255	324 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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