RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 GAKO14976 1311 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 MECOMQ03112 1051 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGEF6Q15052 776 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 RAI14Q9P0K7 980 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 COG6Q9Y2V7 657 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 H0YGN5 161 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 HMMRO75330 724 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 LDHCP07864 332 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 MCAMP43121 646 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 NFIAQ12857 509 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 CCL15Q16663 113 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 PI16Q6UXB8 463 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 COL6A3P12111 3177 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 BTDP43251 543 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 OTUD5Q96G74 571 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ENTPD3O75355 529 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 GTF2A2P52657 109 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 IDI2Q9BXS1 227 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 DOCK2Q92608 1830 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 RGS3P49796 1198 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ERO1BQ86YB8 467 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 SNRKQ9NRH2 765 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 PICALMQ13492 652 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 PDE3AQ14432 1141 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 AACSQ86V21 672 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 IGSF3O75054 1194 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 BAG3O95817 575 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 CETPP11597 493 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 SNAPC2Q13487 334 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 KIF22Q14807 665 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 TLR2O60603 784 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 PLCG2P16885 1265 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 INPP5BP32019 993 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 PPIL2Q13356 520 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF384Q8TF68 577 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 SHISA4Q96DD7 197 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 APBB1O00213 710 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZAP70P43403 619 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 RHBDL3P58872 404 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 PPATQ06203 517 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS2-204ENST00000571386 A0A0C4DFX4 3053 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 IRF6O14896 467 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 GNRH1P01148 92 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 TEX11Q8IYF3 940 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 PICK1Q9NRD5 415 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 MGAMO43451 1857 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 BTBD19C9JJ37 291 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 RAB11FIP3O75154 756 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS2-204ENST00000571386 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms