RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 EFCC1Q9HA90 598 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 GPR108Q9NPR9 543 aa25.76■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.76■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 PANK1Q8TE04 598 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF384Q8TF68 577 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 SNRKQ9NRH2 765 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.74■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 DOCK1Q14185 1865 aa25.73■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.73■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.72■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.72■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 RHBDL3P58872 404 aa25.72■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF6Q15052 776 aa25.72■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 PICK1Q9NRD5 415 aa25.72■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.72■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.71■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 TLR2O60603 784 aa25.71■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 CAP1Q01518 475 aa25.71■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.71■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PPP4C-211ENST00000567642 SLURP2P0DP57 97 aa25.7■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CEP85Q6P2H3 762 aa25.7■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.7■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.69■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.69■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 TEX11Q8IYF3 940 aa25.69■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.69■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRFP10586 1907 aa25.69■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 PDHXO00330 501 aa25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 MS4A1P11836 297 aa25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 KIF22Q14807 665 aa25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.68■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CXCL11O14625 94 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRAP18433 802 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K10Q02779 954 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ZAP70P43403 619 aa25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CPA4Q9UI42 421 aa25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.66■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 FAM196BA6NMK8 535 aa25.65■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 BAG3O95817 575 aa25.65■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.65■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 FOCADQ5VW36 1801 aa25.65■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 MOGSQ13724 837 aa25.64■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.64■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.64■■□□□ 1.7
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D12O60347 775 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 C17orf99Q6UX52 265 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 MGAMO43451 1857 aa25.62■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PLCG2P16885 1265 aa25.62■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 COG6Q9Y2V7 657 aa25.62■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM75PA6NK02 468 aa25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 AACSQ86V21 672 aa25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 ARMC5Q96C12 935 aa25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.6■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.6■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.6■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 MYH1P12882 1939 aa25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms