RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP3K11Q16584 847 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 JMYQ8N9B5 988 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLCG2P16885 1265 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADD2P35612 726 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRM1Q13255 1194 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 RGMBQ6NW40 437 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 AOC2O75106 756 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 ECE1P42892 770 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 FLT1P17948 1338 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLC10A3P09131 477 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 CSRNP1Q96S65 589 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.46■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLURP2P0DP57 97 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 UBE3CQ15386 1083 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 CERS3Q8IU89 383 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCORLQ8N3X6 602 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 HOOK2Q96ED9 719 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZIC5Q96T25 663 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 DOCK1Q14185 1865 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDE4AP27815 886 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCAF15Q66K64 600 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC102AQ96A19 550 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 MBD4O95243 580 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 WRNIP1Q96S55 665 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 NOGQ13253 232 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 VGLL4Q14135 290 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARMT1Q9H993 441 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 UNCXA6NJT0 531 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 FSD1Q9BTV5 496 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM196BA6NMK8 535 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 INPP5BP32019 993 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP2K2P36507 400 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP5P45974 858 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP3K9P80192 1104 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP3K10Q02779 954 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ELP3Q9H9T3 547 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 PALD1Q9ULE6 856 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 GJA5P36382 358 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPRYD7Q5W111 196 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 APPBP2Q92624 585 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 OSBP2Q969R2 916 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 WNK4Q96J92 1243 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 NEFLP07196 543 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 EVI5LQ96CN4 794 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 CSADQ9Y600 493 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 M0R2C6 588 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRKAB2O43741 272 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 TBC1D12O60347 775 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 AIDAQ96BJ3 306 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 DNAJC18Q9H819 358 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms