RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTDP43251 543 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOMM22Q9NS69 142 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLCG2P16885 1265 aa20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 DACT2Q5SW24 774 aa20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTR9Q6PD62 1173 aa20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L3A6NCW0 530 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L4A6NCW7 530 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM4AO75164 1064 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 SBK1Q52WX2 424 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 MXD3Q9BW11 206 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT23Q9C075 422 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L12C9JPN9 530 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L21D6R901 530 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 STX6O43752 255 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 JAK2O60674 1132 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.97■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCN9AQ15858 1988 aa20.96■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.96■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP5P45974 858 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 EVCP57679 992 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 RHBDL3P58872 404 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCTP1Q6DN14 999 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRIQ9BWK5 157 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 YDJCA8MPS7 323 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 F8W031 263 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGRP09769 529 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 EVX2Q03828 476 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP2D6P10635 497 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLHL34Q8N239 644 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX11Q96FC9 970 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM87BQ96K49 555 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SENP2Q9HC62 589 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMB1P07942 1786 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTDNEP1O95476 244 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX11Q8IYF3 940 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEKT1Q969V4 418 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTMR6Q9Y217 621 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L8P0C7I0 530 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTA3Q9BTC8 594 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 LY9Q9HBG7 655 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPON1Q9HCB6 807 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL4A5P29400 1685 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAK2O60296 914 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPFIA3O75145 1194 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCNN1DP51172 638 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 C12orf60Q5U649 245 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSME4Q14997 1843 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRDM1O75626 825 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDCP20941 246 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms