RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 ADCY9O60503 1353 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 GLTPD2A6NH11 291 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLURP2P0DP57 97 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 GSK3AP49840 483 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 KCNMA1Q12791 1236 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 GRAPQ13588 217 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 RNF20Q5VTR2 975 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINS1Q8NG48 757 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 JDP2Q8WYK2 163 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-206ENST00000560350 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 GPC1P35052 558 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 C1QTNF8P60827 252 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 SYNE4Q8N205 404 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 SNRKQ9NRH2 765 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ABCC12Q96J65 1359 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A1W2PRU2 124 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 H7C1W4 665 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 TOMM70O94826 608 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 SCTRP47872 440 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 RASSF7Q02833 373 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 G2E3Q7L622 706 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.57□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 PTPRCP08575 1304 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 SCN7AQ01118 1682 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 MEN1O00255 615 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ALDH1L1O75891 902 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGKV5-2P06315 115 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 RHOQP17081 205 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 GCKRQ14397 625 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 WHAMMQ8TF30 809 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF592Q92610 1267 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ABCC4O15439 1325 aa9.56□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 FZD9O00144 591 aa9.55□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 GAS6Q14393 721 aa9.55□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 BEND3Q5T5X7 828 aa9.55□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRAK2O60296 914 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 FSTL1Q12841 308 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 EYA3Q99504 573 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 RRAGCQ9HB90 399 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.54□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARHGEF15O94989 841 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CSF1RP07333 972 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRELPP51888 382 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CTSWP56202 376 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CLN3Q13286 438 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 NIM1KQ8IY84 436 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 SVOPQ8N4V2 548 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
USP3-AS1-206ENST00000560350 APBB1O00213 710 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 PPIP5K2O43314 1243 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 WASHC4Q2M389 1173 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 GPC2Q8N158 579 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.52□□□□□ -0.89
USP3-AS1-206ENST00000560350 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms