RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATG3Q9NT62 314 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ICMTO60725 284 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTSBP07858 339 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCC5O15440 1437 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM6BO15054 1643 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADH5P11766 374 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOSL1P15407 271 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP11P51784 963 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFKBIBQ15653 356 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAOXQ6QHF9 649 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADMP35318 185 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 GATA6Q92908 595 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 USTQ9Y2C2 406 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAPKBP1O60336 1514 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCC1P33527 1531 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 HFM1A2PYH4 1435 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLCH2O75038 1416 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAOBP27338 520 aa8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZAR1Q86SH2 424 aa8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPOAP1O95153 1857 aa8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAIPQ13075 1403 aa8.02□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 H3BRB1 525 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 B3GALT4O96024 378 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRNPP04156 253 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP11A1P05108 521 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERPINB4P48594 390 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGAP4P98171 946 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 POU4F3Q15319 338 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKNAQ7Z591 1439 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 FANCAO15360 1455 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ECEL1O95672 775 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 FZD5Q13467 585 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABI1Q8IZP0 508 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF576Q9H609 170 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC39Q9UFE4 941 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 DIP2BQ9P265 1576 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBD5Q9P267 1494 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITPKAP23677 461 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD109Q6YHK3 1445 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM129BQ96TA1 746 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADGRL2O95490 1459 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ROCK1Q13464 1354 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM170BA6NMN3 283 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEFLP07196 543 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ORC1Q13415 861 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF114Q9Y508 228 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADGRL1O94910 1474 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.98□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP26A1O43174 497 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NDUFB5O43674 189 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFICP08651 508 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPY4P0CV99 314 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPY10P0CW01 314 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB6AP20340 208 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms