RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-211	ENST00000553920	PTPRF	P10586	1907 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920		H0YGN5	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	RGS3	P49796	1198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PRMT2	P55345	433 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	TIMM10	P62072	90 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF384	Q8TF68	577 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CXCL11	O14625	94 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	SEMA3E	O15041	775 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PTPRA	P18433	802 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GRK4	P32298	578 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PRKCZ	Q05513	592 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	MEIS3	Q99687	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	MYPN	Q86TC9	1320 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ENTPD3	O75355	529 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	NEFL	P07196	543 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CCL5	P13501	91 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GJA8	P48165	433 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GJB1	P08034	283 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	HOXD10	P28358	340 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	RHBDL3	P58872	404 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CEP290	O15078	2479 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920		A0A1B0GUL7	405 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	BTD	P43251	543 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	MECOM	Q03112	1051 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TFCP2	Q12800	502 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	PICALM	Q13492	652 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TRIM75P	A6NK02	468 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	ELN	P15502	786 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	FLT3LG	P49771	235 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	FCGRT	P55899	365 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TREML2	Q5T2D2	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	DPF3	Q92784	378 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	PICK1	Q9NRD5	415 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	LAMA3	Q16787	3333 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	ADCY3	O60266	1144 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	TBC1D12	O60347	775 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	SGPL1	O95470	568 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	MTX1	Q13505	466 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-211	ENST00000553920	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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