RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.76□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.76□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PTPRAP18433 802 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NFIAQ12857 509 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SHHQ15465 462 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINS1Q8NG48 757 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 USP40Q9NVE5 1235 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PNMA3Q9UL41 463 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAST3O60307 1309 aa9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MYH3P11055 1940 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COL6A1P12109 1028 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAP3K12Q12852 859 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TREML2Q5T2D2 321 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRIB2Q92519 343 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MGAMO43451 1857 aa9.74□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FLIIQ13045 1269 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RALBP1Q15311 655 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PPM1EQ8WY54 764 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 APAF1O14727 1248 aa9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 METTL24Q5JXM2 366 aa9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LHX8Q68G74 356 aa9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.72□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SLURP2P0DP57 97 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SPP2Q13103 211 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PDE3AQ14432 1141 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 USP38Q8NB14 1042 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.71□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 F6X3S4 739 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RGS3P49796 1198 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RTP1P59025 263 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 BADQ92934 168 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AK9Q5TCS8 1911 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.7□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GRM8O00222 908 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PEX10O60683 326 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PDE8BO95263 885 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNGA1P29973 690 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HMGCS2P54868 508 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GRIN2CQ14957 1233 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCL14Q16627 93 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LRRC24Q50LG9 513 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IL27Q8NEV9 243 aa9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ENTPD3O75355 529 aa9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RGS2P41220 211 aa9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PICALMQ13492 652 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms