RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 GGA3Q9NZ52 723 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.77□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.77□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 KIF3CO14782 793 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 REC8O95072 547 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SEC24BO95487 1268 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 POTEIP0CG38 1075 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 POTEJP0CG39 1038 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 YY1P25490 414 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 USP5P45974 858 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 RASA3Q14644 834 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CTR9Q6PD62 1173 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TEPSINQ96N21 525 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 VEZTQ9HBM0 779 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 APPP05067 770 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TNNI2P48788 182 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 MAP3K10Q02779 954 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 C12orf60Q5U649 245 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 USP26Q9BXU7 913 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 BACH2Q9BYV9 841 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 USP17L12C9JPN9 530 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 USP17L21D6R901 530 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TCP10Q12799 353 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 PICALMQ13492 652 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 NECTIN1Q15223 517 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 MYH7P12883 1935 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 PLCD1P51178 756 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SULF1Q8IWU6 871 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 KCNB2Q92953 911 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 NAPBQ9H115 298 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 EHD4Q9H223 541 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 PALD1Q9ULE6 856 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TBC1D12O60347 775 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 FGRP09769 529 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TDO2P48775 406 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 GABPAQ06546 454 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CHADLQ6NUI6 762 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TTC6Q86TZ1 520 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 USP48Q86UV5 1035 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CYP2D6P10635 497 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 NBPF3Q9H094 633 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 AK9Q5TCS8 1911 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ADM5C9JUS6 153 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SMIM22K7EJ46 135 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CYP21A2P08686 494 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 HSPA4P34932 840 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 EVX2Q03828 476 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 PPARAQ07869 468 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 IL17RAQ96F46 866 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 CSRNP1Q96S65 589 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-217ENST00000537757 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.71□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ZNF213O14771 459 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 HLA-DOAP06340 250 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 DLK2Q6UY11 383 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms