RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 NEDD4P46934 1319 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 F8W031 263 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 GJB2P29033 226 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 ANTXR2P58335 489 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 CNKSR1Q969H4 720 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 RBSNQ9H1K0 784 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 CACNA1SQ13698 1873 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 C21orf2O43822 256 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 CCDC125Q86Z20 511 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 EVX2Q03828 476 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 COA1Q9GZY4 146 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG13-211ENST00000528494 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 PPARAQ07869 468 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 USP17L12C9JPN9 530 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 USP17L21D6R901 530 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KDM4AO75164 1064 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SCRN1Q12765 414 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 DPEP1P16444 411 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 GTF3C6Q969F1 213 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 JAK2O60674 1132 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 PRDM1O75626 825 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SYT1P21579 422 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 CTR9Q6PD62 1173 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 DDX11Q96FC9 970 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 EYA3Q99504 573 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 ZMYM6O95789 1325 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 GSTO1P78417 241 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KLHL34Q8N239 644 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SENP2Q9HC62 589 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SLX4Q8IY92 1834 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 BRD1O95696 1058 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 CYP2D6P10635 497 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 USP5P45974 858 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 AOC3Q16853 763 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 CERS5Q8N5B7 392 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 BAG3O95817 575 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 BTDP43251 543 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 TTLL6Q8N841 843 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 TSC1Q92574 1164 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 LAMA4Q16363 1823 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 STX6O43752 255 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 PFKFB2O60825 505 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 LDHCP07864 332 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 USP17L8P0C7I0 530 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 RXRAP19793 462 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SCNN1DP51172 638 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 MCTP1Q6DN14 999 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 ZBTB22O15209 634 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KCNA3P22001 575 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KRT23Q9C075 422 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 KIF3AQ9Y496 699 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 LTBP1Q14766 1721 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG13-211ENST00000528494 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms