RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 RGS3P49796 1198 aa20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 PPP4CP60510 307 aa20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 TCP10Q12799 353 aa20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 FAM151AQ8WW52 585 aa20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 STAP2Q9UGK3 403 aa20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.04■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 NF2P35240 595 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 PDE1AP54750 535 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 PRKG1Q13976 671 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 OTOFQ9HC10 1997 aa20.03■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 ENTPD3O75355 529 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 SLC10A3P09131 477 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 ADD2P35612 726 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 PICALMQ13492 652 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K11Q16584 847 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 CCDC102AQ96A19 550 aa20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HACE1-211ENST00000521962 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.01■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.01■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 TEX11Q8IYF3 940 aa20.01■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 FOCADQ5VW36 1801 aa20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 ERC2O15083 957 aa20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 PDE4AP27815 886 aa20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 LDLRAD1Q5T700 205 aa20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 RNF186Q9NXI6 227 aa20■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 BAG3O95817 575 aa19.99■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.99■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 FLT1P17948 1338 aa19.99■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 MYH7P12883 1935 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 SIPA1L1O43166 1804 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 SLURP2P0DP57 97 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 PLCG2P16885 1265 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 ARMC9Q7Z3E5 817 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 CSRNP1Q96S65 589 aa19.98■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 TRPA1O75762 1119 aa19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 UBE3CQ15386 1083 aa19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 LCORLQ8N3X6 602 aa19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 CLMNQ96JQ2 1002 aa19.97■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.798e-8■■■■□ 25
HACE1-211ENST00000521962 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.96■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19.96■□□□□ 0.79
HACE1-211ENST00000521962 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 MIGA2Q7L4E1 593 aa19.95■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 CERS3Q8IU89 383 aa19.95■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 ARMT1Q9H993 441 aa19.95■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 CENPFP49454 3210 aa19.95■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 MBD4O95243 580 aa19.94■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 IREB2P48200 963 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K10Q02779 954 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 VGLL4Q14135 290 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 DCAF15Q66K64 600 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 OSBP2Q969R2 916 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 HOOK2Q96ED9 719 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 FSD1Q9BTV5 496 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 PCDH10Q9P2E7 1040 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 ZNF112Q9UJU3 913 aa19.93■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 NAV1Q8NEY1 1877 aa19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 FAM196BA6NMK8 535 aa19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 PRKAB2O43741 272 aa19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 GJA5P36382 358 aa19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 SOX10P56693 466 aa19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa19.92■□□□□ 0.78
HACE1-211ENST00000521962 APPBP2Q92624 585 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms