RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520903.1

RNF19A-208, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RNF19A, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-208	ENST00000520903	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	IL2RB	P14784	551 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	HIF1A	Q16665	826 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	SETDB2	Q96T68	719 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	GPAM	Q9HCL2	828 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RNF19A	Q9NV58	838 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	EFS	O43281	561 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ARSD	P51689	593 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	DBN1	Q16643	649 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	XKR5	Q6UX68	686 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NLRP8	Q86W28	1048 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LRRC37A3	O60309	1634 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	INSR	P06213	1382 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RREB1	Q92766	1687 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LTN1	O94822	1766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	VAMP1	P23763	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	USP5	P45974	858 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	AMPH	P49418	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	KCNQ4	P56696	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	AAMP	Q13685	434 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903		E9PSI1	815 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	EGFR	P00533	1210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	BCR	P11274	1271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ORC1	Q13415	861 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	XP32	Q5T750	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	PANK3	Q9H999	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	MYOM1	P52179	1685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LRP5	O75197	1615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NSD2	O96028	1365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	FLT4	P35916	1363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	CYP27B1	O15528	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	RECK	O95980	971 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	MX2	P20592	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	MEGF6	O75095	1541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF19A-208	ENST00000520903	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms