RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKCQQ04759 706 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE1DQ5T752 114 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSRNP1Q96S65 589 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEACAM5P06731 702 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 KSR1Q8IVT5 923 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PICK1Q9NRD5 415 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 U3KQE9 123 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 SULF2Q8IWU5 870 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ISL2Q96A47 359 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC38A3Q99624 504 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBX8Q9HC52 389 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEFMP07197 916 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 OXCT1P55809 520 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PI16Q6UXB8 463 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 DBX1A6NMT0 343 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARNTP27540 789 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 IKZF1Q13422 519 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDZD3Q86UT5 571 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCO2Q9BYV7 579 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSADQ9Y600 493 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVK-24P63145 666 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF214Q8ND24 703 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK35Q8TDR2 534 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHA2P01877 340 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 NME2P22392 152 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPM1JQ5JR12 505 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASB11Q8WXH4 323 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZP2Q05996 745 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNMB1Q16558 191 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 C14orf37Q86TY3 774 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAMM50Q9Y512 469 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLANAQ16655 118 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMC7Q7Z402 723 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 C12orf40Q86WS4 652 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM84AQ96KN4 292 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARID3AQ99856 593 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO24O75426 580 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSTT1P30711 240 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLCB3Q01970 1234 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELMO3Q96BJ8 720 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP44Q9C0F1 390 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms