RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 HECW1Q76N89 1606 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 ARNTP27540 789 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 RNF208Q9H0X6 261 aa9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-225ENST00000515835 CLIP1P30622 1438 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 UNCXA6NJT0 531 aa9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-225ENST00000515835 CELA3AP09093 270 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZS46 218 aa9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-225ENST00000515835 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 PAGE1O75459 146 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 RLBP1P12271 317 aa9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-225ENST00000515835 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-225ENST00000515835 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-225ENST00000515835 KRT82Q9NSB4 513 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-225ENST00000515835 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ALX3O95076 343 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 BMP6P22004 513 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.884e-6■□□□□ 11.2
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PDE4D-225ENST00000515835 BACH2Q9BYV9 841 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC14Q15048 493 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 CEP41Q9BYV8 373 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 KIF14Q15058 1648 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 RECKO95980 971 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 RICTORQ6R327 1708 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 RASIP1Q5U651 963 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 ZNF428Q96B54 188 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-225ENST00000515835 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 RAD18Q9NS91 495 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF862O60290 1169 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-225ENST00000515835 AOC2O75106 756 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-225ENST00000515835 TIAF1O95411 115 aa9.52□□□□□ -0.89
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