RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 ELP3Q9H9T3 547 aa28.3■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 PPP4CP60510 307 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 WNK4Q96J92 1243 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 AK9Q5TCS8 1911 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 VGLL4Q14135 290 aa28.28■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.28■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.28■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 LBX1P52954 281 aa28.27■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 HAUS7Q99871 368 aa28.27■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 TSKSQ9UJT2 592 aa28.27■■■□□ 2.12
PITX1-202ENST00000502676 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 SREBF2Q12772 1141 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 GCC1Q96CN9 775 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 OTOFQ9HC10 1997 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 OPTNQ96CV9 577 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 DOCK2Q92608 1830 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 CERS3Q8IU89 383 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 TRPA1O75762 1119 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 PDE6AP16499 860 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 RNF186Q9NXI6 227 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 INPP5BP32019 993 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 GJA5P36382 358 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 TM4SF4P48230 202 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 OTUD5Q96G74 571 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 ZNF112Q9UJU3 913 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.2■■■□□ 2.11
PITX1-202ENST00000502676 INHBEP58166 350 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 ERO1BQ86YB8 467 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 FLT1P17948 1338 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 USP5P45974 858 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 ERC2O15083 957 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 SLURP2P0DP57 97 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 MAP3K10Q02779 954 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 PHF20L1A8MW92 1017 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 TBC1D12O60347 775 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 MX1P20591 662 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 ADD2P35612 726 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 FAM196BA6NMK8 535 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 GTF2A2P52657 109 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 IFNL1Q8IU54 200 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 ALDH1A1P00352 501 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 IGHDP01880 384 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 PPATQ06203 517 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 PPIL2Q13356 520 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 PICK1Q9NRD5 415 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 PALD1Q9ULE6 856 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX1-202ENST00000502676 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 HLA-DOAP06340 250 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 IRF6O14896 467 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-202ENST00000502676 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms