RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 FOCADQ5VW36 1801 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 TRPA1O75762 1119 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 BAG3O95817 575 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP7A1P22680 504 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 TM4SF4P48230 202 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 TEX11Q8IYF3 940 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 CSADQ9Y600 493 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP5JP18859 108 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 GJA5P36382 358 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP4CP60510 307 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 MAP3K12Q12852 859 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 OPTNQ96CV9 577 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 GOLIM4O00461 696 aa20.54■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 SREBF2Q12772 1141 aa20.54■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.54■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 PLCG2P16885 1265 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 INPP5BP32019 993 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 HAUS7Q99871 368 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-205ENST00000496887 SLURP2P0DP57 97 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 INHBEP58166 350 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 AAMPQ13685 434 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 OTUD5Q96G74 571 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 MYH7P12883 1935 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 MAP3K10Q02779 954 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 PDE6AP16499 860 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 ERO1BQ86YB8 467 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TNS4Q8IZW8 715 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 MYH1P12882 1939 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 SIPA1L1O43166 1804 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D8O95759 1140 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 IFNL1Q8IU54 200 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 GPATCH3Q96I76 525 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 FLT1P17948 1338 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 DOCK1Q14185 1865 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 CERS3Q8IU89 383 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM196BA6NMK8 535 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D12O60347 775 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 GTF2A2P52657 109 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 PPIL2Q13356 520 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 GCC1Q96CN9 775 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPN18Q99952 460 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-205ENST00000496887 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 IRF6O14896 467 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 ALDH1A1P00352 501 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 USP5P45974 858 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 PPATQ06203 517 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 CCL15Q16663 113 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 PALD1Q9ULE6 856 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 ADD2P35612 726 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-205ENST00000496887 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms