RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 HUNKP57058 714 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 PPP4CP60510 307 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 STAP2Q9UGK3 403 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ENTPD3O75355 529 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 BAG3O95817 575 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 PDE4AP27815 886 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 VEGFBP49765 207 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 FKBP1BP68106 108 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 TEX11Q8IYF3 940 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 SLURP2P0DP57 97 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 PLCG2P16885 1265 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 GRM1Q13255 1194 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 MAP3K11Q16584 847 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 RGMBQ6NW40 437 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ARMC9Q7Z3E5 817 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 CAPNS2Q96L46 248 aa10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.732e-8■■■□□ 18.2
PKP4-216ENST00000495123 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 NEFLP07196 543 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 UBE3CQ15386 1083 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 LCORLQ8N3X6 602 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 FLT1P17948 1338 aa10.46□□□□□ -0.73
PKP4-216ENST00000495123 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.46□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 AOC2O75106 756 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 CLMNQ96JQ2 1002 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 CSRNP1Q96S65 589 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ZIC5Q96T25 663 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 FSD1Q9BTV5 496 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ARMT1Q9H993 441 aa10.45□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 FAM196BA6NMK8 535 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 PRKAB2O43741 272 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 MBD4O95243 580 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 SLC10A3P09131 477 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ECE1P42892 770 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 USP5P45974 858 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 DCAF15Q66K64 600 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 CERS3Q8IU89 383 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 JMYQ8N9B5 988 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 APPBP2Q92624 585 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 OSBP2Q969R2 916 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 EVI5LQ96CN4 794 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 HOOK2Q96ED9 719 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 OTOFQ9HC10 1997 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 MYH7P12883 1935 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 FOCADQ5VW36 1801 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 M0R2C6 588 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 INPP5BP32019 993 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 MAP3K9P80192 1104 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 VGLL4Q14135 290 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 SKAP1Q86WV1 359 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PKP4-216ENST00000495123 RILPL2Q969X0 211 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms