RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493060.5

NVL-222, Transcript of nuclear VCP-like, human

TSL 2

Gene NVL, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NVL-222	ENST00000493060		F6X3S4	739 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	OSBP	P22059	807 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	GJA5	P36382	358 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	PPP4C	P60510	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	TATDN2	Q93075	761 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	MTR	Q99707	1265 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	E2F4	Q16254	413 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NVL-222	ENST00000493060	GRM8	O00222	908 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CAP1	Q01518	475 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	INHBE	P58166	350 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	MYO1B	O43795	1136 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PLIN1	O60240	522 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	GYG1	P46976	350 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CRHR2	Q13324	411 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	RASA3	Q14644	834 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PTPN18	Q99952	460 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	GRIK5	Q16478	980 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NVL-222	ENST00000493060	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms