RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 GFRA2O00451 464 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 TM4SF5O14894 197 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF862O60290 1169 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LIG1P18858 919 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 DGKGP49619 791 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PDE4BQ07343 736 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 SERINC3Q13530 473 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 RRAGCQ9HB90 399 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 GRIN3BO60391 1043 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 GMPRP36959 345 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 RAC1P63000 192 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 INPP5AQ14642 412 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 RAD18Q9NS91 495 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3R2O00459 728 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 WFS1O76024 890 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 CTSBP07858 339 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO11Q86XK2 927 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PIF1Q9H611 641 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 TLDC2A0PJX2 215 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 AOC2O75106 756 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM11O75078 769 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 HTR3BO95264 441 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 SELPP16109 830 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 CDK8P49336 464 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 CASP7P55210 303 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TM9SF2Q99805 663 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 WDR18Q9BV38 432 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A0MRY4 1105 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 PLCG1P19174 1290 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-24P63145 666 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 DLL1O00548 723 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 ID3Q02535 119 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 FXNQ16595 210 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 SVOPQ8N4V2 548 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 PICK1Q9NRD5 415 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 GMIPQ9P107 970 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 MEGF11A6BM72 1044 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 DLGAP3O95886 979 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R5EQ16537 467 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TREML4Q6UXN2 200 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf40Q86WS4 652 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 WHAMMQ8TF30 809 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 FANCGO15287 622 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 PGRP06401 933 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms